rtStar™ Pre-designed Functional LncRNA Primer Sets (H/M)
Arraystar supplies pre-designed Functional LncRNA-specific PCR primers for the accurate quantification of individual Functional LncRNA transcripts in qPCR.
Benefits
• Reliable results with validated long non-coding (LncRNA) primers
• High sensitivity and specificity
• Accurate quantification over a wide linear range
• Time and cost savings with validated primers and SYBR Green assay
The Primer Sets perform superbly with the rtStar™ First-Strand cDNA Synthesis Kit (CAT# AS-FS-001) and Arraystar SYBR Green qPCR Master Mix.
| Product Name | Catalog No. | Description | Size | Price |
|---|---|---|---|---|
| rtStar™ Pre-designed Human Functional LncRNA qPCR Primer Pair | AS-NR-004-1-M | 200 reactions | $175.00 | |
| rtStar™ Pre-designed Mouse Functional LncRNA qPCR Primer Pair | AS-NR-004M-1-M | 200 reactions | $175.00 |
rtStar™ Pre-designed Functional LncRNA Primer Sets are part of the nrStar™ Functional LncRNA PCR System, and can be used in combination with rtStar™ First-Strand cDNA Synthesis Kit(AS-FS-001) for Functional LncRNA transcripts detection and quantification. All the primers have been validated across numerous cultured cell lines and tissues, and guarantee the most accurate and specific performance when used with Arraystar SYBR Green qPCR Master Mix (Figure 1).
Figure 1. Amplification curve (A) and Dissociation curve (B) of example Human LncRNA EGFR-AS1.
| LncRNA name | Transcript ID | Catalog Number |
| AB073614 | AB073614 | AS-NR-004-1-001 |
| AF339813 | AF339813 | AS-NR-004-1-002 |
| CILinc01 | ENST00000417650 | AS-NR-004-1-003 |
| CILinc02 | ENST00000565297 | AS-NR-004-1-004 |
| ENST00000456816 | ENST00000456816 | AS-NR-004-1-005 |
| ENST00000434223 | ENST00000434223 | AS-NR-004-1-006 |
| CTB-89H12.4 | ENST00000499521 | AS-NR-004-1-007 |
| CHL1-AS2 | ENST00000452919 | AS-NR-004-1-008 |
| KRT7-AS | ENST00000546686 | AS-NR-004-1-009 |
| LINC00237 | ENST00000421023 | AS-NR-004-1-010 |
| KRASP1 | ENST00000407852 | AS-NR-004-1-011 |
| anti-NOS2A | ENST00000583164 | AS-NR-004-1-012 |
| BPESC1 | NR_026783 | AS-NR-004-1-013 |
| ABHD11-AS1 | NR_026690 | AS-NR-004-1-014 |
| EMX2OS | NR_002791 | AS-NR-004-1-015 |
| FER1L4 | NR_119376 | AS-NR-004-1-016 |
| ATXN8OS | NR_002717 | AS-NR-004-1-017 |
| HIF1A-AS1 | NR_047116 | AS-NR-004-1-018 |
| CECR3 | NR_038398 | AS-NR-004-1-019 |
| LINC00707 | NR_038291 | AS-NR-004-1-020 |
| FAS-AS1 (SAF) | NR_028371 | AS-NR-004-1-021 |
| BOK-AS1 | NR_033346 | AS-NR-004-1-022 |
| LINC00032 | NR_026679 | AS-NR-004-1-023 |
| DISC2 | NR_002227 | AS-NR-004-1-024 |
| DANCR | NR_024031 | AS-NR-004-1-025 |
| HULC | NR_004855 | AS-NR-004-1-026 |
| KCNIP4-IT1 | NR_002813 | AS-NR-004-1-027 |
| DIO3OS | NR_002770 | AS-NR-004-1-028 |
| HOTTIP | NR_037843 | AS-NR-004-1-029 |
| LINC00312 | NR_024065 | AS-NR-004-1-030 |
| HCP5 | NR_040662 | AS-NR-004-1-031 |
| GNAS-AS1 | NR_002785 | AS-NR-004-1-032 |
| IPW | NR_023915 | AS-NR-004-1-033 |
| HYMAI | NR_002768 | AS-NR-004-1-034 |
| BANCR | NR_047671 | AS-NR-004-1-035 |
| LINC00570 | NR_047499 | AS-NR-004-1-036 |
| HAS2-AS1 | NR_002835 | AS-NR-004-1-037 |
| AFAP1-AS1 | NR_026892 | AS-NR-004-1-038 |
| LINC00271 | NR_026805 | AS-NR-004-1-039 |
| EGOT | NR_004428 | AS-NR-004-1-040 |
| HIF1A-AS2 | NR_045406 | AS-NR-004-1-041 |
| GATA6-AS1 | NR_102763 | AS-NR-004-1-042 |
| KCNQ1DN | NR_024627 | AS-NR-004-1-043 |
| DLX6-AS1 | NR_015448 | AS-NR-004-1-044 |
| HOXA11-AS | NR_002795 | AS-NR-004-1-045 |
| HAR1B (HAR1R) | NR_003245 | AS-NR-004-1-046 |
| LINC01133 | NR_038849 | AS-NR-004-1-047 |
| EPB41L4A-AS1 | NR_015370 | AS-NR-004-1-048 |
| DAOA-AS1 | NR_040247 | AS-NR-004-1-049 |
| FALEC | NR_051960 | AS-NR-004-1-050 |
| EWSAT1 | NR_026949 | AS-NR-004-1-051 |
| FENDRR | NR_033925 | AS-NR-004-1-052 |
| GHET1 | NR_130107 | AS-NR-004-1-053 |
| GACAT2 | NR_120598 | AS-NR-004-1-054 |
| GACAT3 | NR_126559 | AS-NR-004-1-055 |
| BACE1-AS | NR_037803 | AS-NR-004-1-056 |
| lincRNA-p21 | lincRNA-p21 | AS-NR-004-1-057 |
| Centromeric alpha-satellite RNA | centromeric_alpha-satellite_RNA_dna | AS-NR-004-1-058 |
| AA174084 | AA174084 | AS-NR-004-1-059 |
| DRAIC (LOC145837) | NR_026979 | AS-NR-004-1-060 |
| FOXCUT | NR_125804 | AS-NR-004-1-061 |
| ACTA2-AS1 | NR_125373 | AS-NR-004-1-062 |
| lincRNA-RoR | NR_048536 | AS-NR-004-1-063 |
| HLX-AS1 | NR_046901 | AS-NR-004-1-064 |
| lincRNA-EPS | NR_123731 | AS-NR-004-1-065 |
| LINC01262 | NR_121679 | AS-NR-004-1-066 |
| BGLT3 | NR_121648 | AS-NR-004-1-067 |
| LINC00901 | NR_121607 | AS-NR-004-1-068 |
| CTBP1-AS | NR_104331 | AS-NR-004-1-069 |
| LINC00970 | NR_104091 | AS-NR-004-1-070 |
| BLACAT1 | NR_103783 | AS-NR-004-1-071 |
| FEZF1-AS1 | NR_036484 | AS-NR-004-1-072 |
| FIRRE | NR_026975 | AS-NR-004-1-073 |
| CCAT2 | NR_109834 | AS-NR-004-1-074 |
| LINC00467 | NR_026761 | AS-NR-004-1-075 |
| FGF10-AS1 | NR_108034 | AS-NR-004-1-076 |
| LINC00581 | NR_103790 | AS-NR-004-1-077 |
| EGFR-AS1 | NR_047551 | AS-NR-004-1-078 |
| LINC00507 | NR_046392 | AS-NR-004-1-079 |
| LINC00951 | NR_038887 | AS-NR-004-1-080 |
| ADAMTS9-AS2 | NR_038264 | AS-NR-004-1-081 |
| DPP10-AS1 | NR_036580 | AS-NR-004-1-082 |
| LINC00473 | NR_026860 | AS-NR-004-1-083 |
| LINC00323 | NR_024100 | AS-NR-004-1-084 |
| LINC00299 | NR_034135 | AS-NR-004-1-085 |
| LINC00850 | NR_109813 | AS-NR-004-1-086 |
| LINC00857 | NR_038464 | AS-NR-004-1-087 |
| FGF14-AS2 | NR_036487 | AS-NR-004-1-088 |
| EPB41L4A-AS2 | NR_027706 | AS-NR-004-1-089 |
| HNF1A-AS1 | NR_024345 | AS-NR-004-1-090 |
| GAS8-AS1 | NR_122031 | AS-NR-004-1-091 |
| APOA1-AS | NR_126362 | AS-NR-004-1-092 |
| HOXA-AS2 | NR_122069 | AS-NR-004-1-093 |
| FTX | NR_028379 | AS-NR-004-1-094 |
| LINC00673 | NR_036488 | AS-NR-004-1-095 |
| 17A | 17A-sequence | AS-NR-004-1-096 |
| 51A | 51A-sequence | AS-NR-004-1-097 |
| 7SK | NR_001445 | AS-NR-004-1-098 |
| CCEPR | NR_131782 | AS-NR-004-1-099 |
| ENST00000480739 | ENST00000480739 | AS-NR-004-1-100 |
| GAS5 | NR_002578 | AS-NR-004-1-101 |
| KCNQ1OT1 | NR_002728 | AS-NR-004-1-102 |
| CCAT1 | NR_108049 | AS-NR-004-1-103 |
| ALIEN | NR_001558 | AS-NR-004-1-104 |
| HAR1A | NR_003244 | AS-NR-004-1-105 |
| KRT18P55 | NR_028334 | AS-NR-004-1-106 |
| LINC00668 | NR_034100 | AS-NR-004-1-107 |
| GUSBP2 | NR_003504 | AS-NR-004-1-108 |
| ecCEBPA | ecCEBPA | AS-NR-004-1-109 |
| lncRNA-CTD903 | ENST00000553153 | AS-NR-004-1-110 |
| lncRNA-HEIH | NR_045680 | AS-NR-004-1-111 |
| LOC100130476 | NR_049793 | AS-NR-004-1-112 |
| LOC100507537 | NR_037902 | AS-NR-004-1-113 |
| LOC100507661 | NR_109989 | AS-NR-004-1-114 |
| LOC101054525 | NR_073144 | AS-NR-004-1-115 |
| LOC101926975 | NR_110558 | AS-NR-004-1-116 |
| LOC102546298 | NR_105061 | AS-NR-004-1-117 |
| LSINCT5 | GU228577 | AS-NR-004-1-118 |
| LUNAR1 | NR_126487 | AS-NR-004-1-119 |
| M18204 | M18204 | AS-NR-004-1-120 |
| MAFTRR | NR_104663 | AS-NR-004-1-121 |
| MALAT1 | NR_002819 | AS-NR-004-1-122 |
| MEG8 | NR_024149 | AS-NR-004-1-123 |
| MEG9 | NR_047664 | AS-NR-004-1-124 |
| MESTIT1 | NR_004382 | AS-NR-004-1-125 |
| MHRT | NR_126491 | AS-NR-004-1-126 |
| MINA | XR_241516 | AS-NR-004-1-127 |
| MIR100HG | NR_024430 | AS-NR-004-1-128 |
| MIR155HG | NR_001458 | AS-NR-004-1-129 |
| MIR222HG | HG512515 | AS-NR-004-1-130 |
| MIR31HG | NR_027054 | AS-NR-004-1-131 |
| MIR7-3HG | NR_027148 | AS-NR-004-1-132 |
| MKRN3-AS1 | DA753755 | AS-NR-004-1-133 |
| MT1JP | NR_036677 | AS-NR-004-1-134 |
| MYCNUT | NR_125783 | AS-NR-004-1-135 |
| NAT-RAD18 | D62839 | AS-NR-004-1-136 |
| NBAT1 | NR_034143 | AS-NR-004-1-137 |
| NDM29 | NDM29_dna | AS-NR-004-1-138 |
| NKILA | NR_131157 | AS-NR-004-1-139 |
| NONHSAT073641 | NONHSAT073641 | AS-NR-004-1-140 |
| NONHSAT112178 | NONHSAT112178 | AS-NR-004-1-141 |
| NONRATT021972 | NONRATT021972 | AS-NR-004-1-142 |
| NORAD | NR_027451 | AS-NR-004-1-143 |
| Novlnc35 | ENST00000441430 | AS-NR-004-1-144 |
| Novlnc76 | GD256884 | AS-NR-004-1-145 |
| NPPA-AS1 | NR_037806 | AS-NR-004-1-146 |
| NPTN-IT1 | NR_103844 | AS-NR-004-1-147 |
| NRAV | NR_038854 | AS-NR-004-1-148 |
| NRIR | NR_126359 | AS-NR-004-1-149 |
| NTT | U54776 | AS-NR-004-1-150 |
| OIP5-AS1 | NR_026757 | AS-NR-004-1-151 |
| OR3A4P | NR_024128 | AS-NR-004-1-152 |
| ORAOV1 | AK294004 | AS-NR-004-1-153 |
| PACERR | NR_125801 | AS-NR-004-1-154 |
| PANCR | ENST00000503456 | AS-NR-004-1-155 |
| PANDAR | NR_109836 | AS-NR-004-1-156 |
| PARROT | ENST00000417112 | AS-NR-004-1-157 |
| PARTICL | NR_038942 | AS-NR-004-1-158 |
| PCAT1 | NR_045262 | AS-NR-004-1-159 |
| PCAT18 | NR_024259 | AS-NR-004-1-160 |
| PCBP2-OT1 | NR_109828 | AS-NR-004-1-161 |
| PCGEM1 | NR_002769 | AS-NR-004-1-162 |
| PDZRN3-AS1 | NR_046681 | AS-NR-004-1-163 |
| PICSAR | NR_024089 | AS-NR-004-1-164 |
| PINC | uc021vwo | AS-NR-004-1-165 |
| PISRT1 | NR_027070 | AS-NR-004-1-166 |
| PNKY | AI826101 | AS-NR-004-1-167 |
| POU6F2-AS2 | XR_242164 | AS-NR-004-1-168 |
| PRINS | AK022045 | AS-NR-004-1-169 |
| PRNCR1 | NR_109833 | AS-NR-004-1-170 |
| PSF inhibiting RNA | PSF_inhibiting_RNA_dna | AS-NR-004-1-171 |
| PTCSC3 | NR_049735 | AS-NR-004-1-172 |
| PTENP1 | NR_023917 | AS-NR-004-1-173 |
| PUNISHER | NR_027032 | AS-NR-004-1-174 |
| PVT1 | NR_003367 | AS-NR-004-1-175 |
| RGMB-AS1 | NR_033932 | AS-NR-004-1-176 |
| RHOXF1P1 | NR_131250 | AS-NR-004-1-177 |
| RMRP | NR_003051 | AS-NR-004-1-178 |
| RMST | NR_024037 | AS-NR-004-1-179 |
| RNY1 | NR_004391 | AS-NR-004-1-180 |
| RP11-354P17.15-001 | ENST00000569618 | AS-NR-004-1-181 |
| RP1-13D10.2 | ENST00000407522 | AS-NR-004-1-182 |
| RUNX1-IT1 | NR_026812 | AS-NR-004-1-183 |
| SALRNA1 | NR_126480 | AS-NR-004-1-184 |
| SAMMSON | NR_110000 | AS-NR-004-1-185 |
| SBF2-AS1 | NR_036485 | AS-NR-004-1-186 |
| SCAANT1 | BU569004 | AS-NR-004-1-187 |
| SENCR | NR_038908 | AS-NR-004-1-188 |
| Six3os | ENST00000437916 | AS-NR-004-1-189 |
| SMILR | ENST00000533992 | AS-NR-004-1-190 |
| SNAR-A1 | NR_004435 | AS-NR-004-1-191 |
| SNHG1 | NR_003098 | AS-NR-004-1-192 |
| SNHG11 | NR_003239 | AS-NR-004-1-193 |
| SNHG14 | ENST00000554726 | AS-NR-004-1-194 |
| SNHG15 | NR_003697 | AS-NR-004-1-195 |
| SNHG20 | NR_027058 | AS-NR-004-1-196 |
| SNHG5 | NR_003038 | AS-NR-004-1-197 |
| SNHG6 | NR_002599 | AS-NR-004-1-198 |
| ST7-AS1 | NR_002330 | AS-NR-004-1-199 |
| ST7-OT3 | NR_002332 | AS-NR-004-1-200 |
| ST7-OT4 | NR_002329 | AS-NR-004-1-201 |
| SUMO1P3 | NR_002190 | AS-NR-004-1-202 |
| TapSAKI | NR_126469 | AS-NR-004-1-203 |
| TARID | NR_109982 | AS-NR-004-1-204 |
| TCL6 | NR_028288 | AS-NR-004-1-205 |
| TDRG1 | NR_024015 | AS-NR-004-1-206 |
| TERMINATOR | uc010ppi | AS-NR-004-1-207 |
| THRIL | NR_110375 | AS-NR-004-1-208 |
| TIE1-AS | GU166386 | AS-NR-004-1-209 |
| TINCR | NR_027064 | AS-NR-004-1-210 |
| TUSC8 | NR_104174 | AS-NR-004-1-211 |
| U1 spliceosomal lncRNA | ENST00000415386 | AS-NR-004-1-212 |
| U79277 | U79277 | AS-NR-004-1-213 |
| uc.338 | ENST00000613162 | AS-NR-004-1-214 |
| uc.73A(P) | uc.73- | AS-NR-004-1-215 |
| UCA1 | NR_015379 | AS-NR-004-1-216 |
| UCH1LAS | NR_102709 | AS-NR-004-1-217 |
| UFC1 lincRNA | KJ809564 | AS-NR-004-1-218 |
| VIM2P | NG_022326 | AS-NR-004-1-219 |
| VLDLR-AS1 | NR_015375 | AS-NR-004-1-220 |
| WSPAR | NR_131252 | AS-NR-004-1-221 |
| X91348 | X91348 | AS-NR-004-1-222 |
| XACT | NR_131204 | AS-NR-004-1-223 |
| XIST | NR_001564 | AS-NR-004-1-224 |
| Yiya | NR_046189 | AS-NR-004-1-225 |
| ZEB2-AS1 | NR_040248 | AS-NR-004-1-226 |
| AIRN-1 | NR_047511 | AS-NR-004-1-227 |
| AIRN-2 | NR_047514 | AS-NR-004-1-228 |
| APOC1P1 | NR_028412; NR_028413; NR_028414 | AS-NR-004-1-229 |
| ARA | NR_136740; NR_136741; NR_136742; NR_136743; NR_136744; NR_136745; NR_136746 | AS-NR-004-1-230 |
| ATG9B-1 | NR_133652 | AS-NR-004-1-231 |
| ATG9B-2 | NR_073169 | AS-NR-004-1-232 |
| BDNF-AS-1 | NR_002832 | AS-NR-004-1-233 |
| BDNF-AS-2 | NR_002832; NR_033312; NR_033313; NR_033314; NR_033315 | AS-NR-004-1-234 |
| Beta-globin-transcript-1 | AY034469 | AS-NR-004-1-235 |
| BCAR4-1 | NR_024049 | AS-NR-004-1-236 |
| BCAR4-2 | NR_024049; NR_024050; NR_131216; NR_131217; NR_131222 | AS-NR-004-1-237 |
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