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rtStar™ Pre-designed Functional LncRNA Primer Sets (H/M)
Benefits
• Reliable results with validated long non-coding (LncRNA) primers
• High sensitivity and specificity
• Accurate quantification over a wide linear range
• Time and cost savings with validated primers and SYBR Green assay
The Primer Sets perform superbly with the rtStar™ First-Strand cDNA Synthesis Kit (CAT# AS-FS-001) and Arraystar SYBR Green qPCR Master Mix.
Promo: 30% OFF! Valid through 3/31/2026
| Product Name | Catalog No. | Description | Size | Price |
|---|---|---|---|---|
| rtStar™ Pre-designed Human Functional LncRNA qPCR Primer Pair | AS-NR-004-1-M | 200 reactions | ||
| rtStar™ Pre-designed Mouse Functional LncRNA qPCR Primer Pair | AS-NR-004M-1-M | 200 reactions |
rtStar™ Pre-designed Functional LncRNA Primer Sets are part of the nrStar™ Functional LncRNA PCR System, and can be used in combination with rtStar™ First-Strand cDNA Synthesis Kit(AS-FS-001) for Functional LncRNA transcripts detection and quantification. All the primers have been validated across numerous cultured cell lines and tissues, and guarantee the most accurate and specific performance when used with Arraystar SYBR Green qPCR Master Mix (Figure 1).

Figure 1. Amplification curve (A) and Dissociation curve (B) of example Human LncRNA EGFR-AS1.
| LncRNA name | Transcript ID | Catalog Number |
| AB073614 | AB073614 | AS-NR-004-1-001 |
| AF339813 | AF339813 | AS-NR-004-1-002 |
| CILinc01 | ENST00000417650 | AS-NR-004-1-003 |
| CILinc02 | ENST00000565297 | AS-NR-004-1-004 |
| ENST00000456816 | ENST00000456816 | AS-NR-004-1-005 |
| ENST00000434223 | ENST00000434223 | AS-NR-004-1-006 |
| CTB-89H12.4 | ENST00000499521 | AS-NR-004-1-007 |
| CHL1-AS2 | ENST00000452919 | AS-NR-004-1-008 |
| KRT7-AS | ENST00000546686 | AS-NR-004-1-009 |
| LINC00237 | ENST00000421023 | AS-NR-004-1-010 |
| KRASP1 | ENST00000407852 | AS-NR-004-1-011 |
| anti-NOS2A | ENST00000583164 | AS-NR-004-1-012 |
| BPESC1 | NR_026783 | AS-NR-004-1-013 |
| ABHD11-AS1 | NR_026690 | AS-NR-004-1-014 |
| EMX2OS | NR_002791 | AS-NR-004-1-015 |
| FER1L4 | NR_119376 | AS-NR-004-1-016 |
| ATXN8OS | NR_002717 | AS-NR-004-1-017 |
| HIF1A-AS1 | NR_047116 | AS-NR-004-1-018 |
| CECR3 | NR_038398 | AS-NR-004-1-019 |
| LINC00707 | NR_038291 | AS-NR-004-1-020 |
| FAS-AS1 (SAF) | NR_028371 | AS-NR-004-1-021 |
| BOK-AS1 | NR_033346 | AS-NR-004-1-022 |
| LINC00032 | NR_026679 | AS-NR-004-1-023 |
| DISC2 | NR_002227 | AS-NR-004-1-024 |
| DANCR | NR_024031 | AS-NR-004-1-025 |
| HULC | NR_004855 | AS-NR-004-1-026 |
| KCNIP4-IT1 | NR_002813 | AS-NR-004-1-027 |
| DIO3OS | NR_002770 | AS-NR-004-1-028 |
| HOTTIP | NR_037843 | AS-NR-004-1-029 |
| LINC00312 | NR_024065 | AS-NR-004-1-030 |
| HCP5 | NR_040662 | AS-NR-004-1-031 |
| GNAS-AS1 | NR_002785 | AS-NR-004-1-032 |
| IPW | NR_023915 | AS-NR-004-1-033 |
| HYMAI | NR_002768 | AS-NR-004-1-034 |
| BANCR | NR_047671 | AS-NR-004-1-035 |
| LINC00570 | NR_047499 | AS-NR-004-1-036 |
| HAS2-AS1 | NR_002835 | AS-NR-004-1-037 |
| AFAP1-AS1 | NR_026892 | AS-NR-004-1-038 |
| LINC00271 | NR_026805 | AS-NR-004-1-039 |
| EGOT | NR_004428 | AS-NR-004-1-040 |
| HIF1A-AS2 | NR_045406 | AS-NR-004-1-041 |
| GATA6-AS1 | NR_102763 | AS-NR-004-1-042 |
| KCNQ1DN | NR_024627 | AS-NR-004-1-043 |
| DLX6-AS1 | NR_015448 | AS-NR-004-1-044 |
| HOXA11-AS | NR_002795 | AS-NR-004-1-045 |
| HAR1B (HAR1R) | NR_003245 | AS-NR-004-1-046 |
| LINC01133 | NR_038849 | AS-NR-004-1-047 |
| EPB41L4A-AS1 | NR_015370 | AS-NR-004-1-048 |
| DAOA-AS1 | NR_040247 | AS-NR-004-1-049 |
| FALEC | NR_051960 | AS-NR-004-1-050 |
| EWSAT1 | NR_026949 | AS-NR-004-1-051 |
| FENDRR | NR_033925 | AS-NR-004-1-052 |
| GHET1 | NR_130107 | AS-NR-004-1-053 |
| GACAT2 | NR_120598 | AS-NR-004-1-054 |
| GACAT3 | NR_126559 | AS-NR-004-1-055 |
| BACE1-AS | NR_037803 | AS-NR-004-1-056 |
| lincRNA-p21 | lincRNA-p21 | AS-NR-004-1-057 |
| Centromeric alpha-satellite RNA | centromeric_alpha-satellite_RNA_dna | AS-NR-004-1-058 |
| AA174084 | AA174084 | AS-NR-004-1-059 |
| DRAIC (LOC145837) | NR_026979 | AS-NR-004-1-060 |
| FOXCUT | NR_125804 | AS-NR-004-1-061 |
| ACTA2-AS1 | NR_125373 | AS-NR-004-1-062 |
| lincRNA-RoR | NR_048536 | AS-NR-004-1-063 |
| HLX-AS1 | NR_046901 | AS-NR-004-1-064 |
| lincRNA-EPS | NR_123731 | AS-NR-004-1-065 |
| LINC01262 | NR_121679 | AS-NR-004-1-066 |
| BGLT3 | NR_121648 | AS-NR-004-1-067 |
| LINC00901 | NR_121607 | AS-NR-004-1-068 |
| CTBP1-AS | NR_104331 | AS-NR-004-1-069 |
| LINC00970 | NR_104091 | AS-NR-004-1-070 |
| BLACAT1 | NR_103783 | AS-NR-004-1-071 |
| FEZF1-AS1 | NR_036484 | AS-NR-004-1-072 |
| FIRRE | NR_026975 | AS-NR-004-1-073 |
| CCAT2 | NR_109834 | AS-NR-004-1-074 |
| LINC00467 | NR_026761 | AS-NR-004-1-075 |
| FGF10-AS1 | NR_108034 | AS-NR-004-1-076 |
| LINC00581 | NR_103790 | AS-NR-004-1-077 |
| EGFR-AS1 | NR_047551 | AS-NR-004-1-078 |
| LINC00507 | NR_046392 | AS-NR-004-1-079 |
| LINC00951 | NR_038887 | AS-NR-004-1-080 |
| ADAMTS9-AS2 | NR_038264 | AS-NR-004-1-081 |
| DPP10-AS1 | NR_036580 | AS-NR-004-1-082 |
| LINC00473 | NR_026860 | AS-NR-004-1-083 |
| LINC00323 | NR_024100 | AS-NR-004-1-084 |
| LINC00299 | NR_034135 | AS-NR-004-1-085 |
| LINC00850 | NR_109813 | AS-NR-004-1-086 |
| LINC00857 | NR_038464 | AS-NR-004-1-087 |
| FGF14-AS2 | NR_036487 | AS-NR-004-1-088 |
| EPB41L4A-AS2 | NR_027706 | AS-NR-004-1-089 |
| HNF1A-AS1 | NR_024345 | AS-NR-004-1-090 |
| GAS8-AS1 | NR_122031 | AS-NR-004-1-091 |
| APOA1-AS | NR_126362 | AS-NR-004-1-092 |
| HOXA-AS2 | NR_122069 | AS-NR-004-1-093 |
| FTX | NR_028379 | AS-NR-004-1-094 |
| LINC00673 | NR_036488 | AS-NR-004-1-095 |
| 17A | 17A-sequence | AS-NR-004-1-096 |
| 51A | 51A-sequence | AS-NR-004-1-097 |
| 7SK | NR_001445 | AS-NR-004-1-098 |
| CCEPR | NR_131782 | AS-NR-004-1-099 |
| ENST00000480739 | ENST00000480739 | AS-NR-004-1-100 |
| GAS5 | NR_002578 | AS-NR-004-1-101 |
| KCNQ1OT1 | NR_002728 | AS-NR-004-1-102 |
| CCAT1 | NR_108049 | AS-NR-004-1-103 |
| ALIEN | NR_001558 | AS-NR-004-1-104 |
| HAR1A | NR_003244 | AS-NR-004-1-105 |
| KRT18P55 | NR_028334 | AS-NR-004-1-106 |
| LINC00668 | NR_034100 | AS-NR-004-1-107 |
| GUSBP2 | NR_003504 | AS-NR-004-1-108 |
| ecCEBPA | ecCEBPA | AS-NR-004-1-109 |
| lncRNA-CTD903 | ENST00000553153 | AS-NR-004-1-110 |
| lncRNA-HEIH | NR_045680 | AS-NR-004-1-111 |
| LOC100130476 | NR_049793 | AS-NR-004-1-112 |
| LOC100507537 | NR_037902 | AS-NR-004-1-113 |
| LOC100507661 | NR_109989 | AS-NR-004-1-114 |
| LOC101054525 | NR_073144 | AS-NR-004-1-115 |
| LOC101926975 | NR_110558 | AS-NR-004-1-116 |
| LOC102546298 | NR_105061 | AS-NR-004-1-117 |
| LSINCT5 | GU228577 | AS-NR-004-1-118 |
| LUNAR1 | NR_126487 | AS-NR-004-1-119 |
| M18204 | M18204 | AS-NR-004-1-120 |
| MAFTRR | NR_104663 | AS-NR-004-1-121 |
| MALAT1 | NR_002819 | AS-NR-004-1-122 |
| MEG8 | NR_024149 | AS-NR-004-1-123 |
| MEG9 | NR_047664 | AS-NR-004-1-124 |
| MESTIT1 | NR_004382 | AS-NR-004-1-125 |
| MHRT | NR_126491 | AS-NR-004-1-126 |
| MINA | XR_241516 | AS-NR-004-1-127 |
| MIR100HG | NR_024430 | AS-NR-004-1-128 |
| MIR155HG | NR_001458 | AS-NR-004-1-129 |
| MIR222HG | HG512515 | AS-NR-004-1-130 |
| MIR31HG | NR_027054 | AS-NR-004-1-131 |
| MIR7-3HG | NR_027148 | AS-NR-004-1-132 |
| MKRN3-AS1 | DA753755 | AS-NR-004-1-133 |
| MT1JP | NR_036677 | AS-NR-004-1-134 |
| MYCNUT | NR_125783 | AS-NR-004-1-135 |
| NAT-RAD18 | D62839 | AS-NR-004-1-136 |
| NBAT1 | NR_034143 | AS-NR-004-1-137 |
| NDM29 | NDM29_dna | AS-NR-004-1-138 |
| NKILA | NR_131157 | AS-NR-004-1-139 |
| NONHSAT073641 | NONHSAT073641 | AS-NR-004-1-140 |
| NONHSAT112178 | NONHSAT112178 | AS-NR-004-1-141 |
| NONRATT021972 | NONRATT021972 | AS-NR-004-1-142 |
| NORAD | NR_027451 | AS-NR-004-1-143 |
| Novlnc35 | ENST00000441430 | AS-NR-004-1-144 |
| Novlnc76 | GD256884 | AS-NR-004-1-145 |
| NPPA-AS1 | NR_037806 | AS-NR-004-1-146 |
| NPTN-IT1 | NR_103844 | AS-NR-004-1-147 |
| NRAV | NR_038854 | AS-NR-004-1-148 |
| NRIR | NR_126359 | AS-NR-004-1-149 |
| NTT | U54776 | AS-NR-004-1-150 |
| OIP5-AS1 | NR_026757 | AS-NR-004-1-151 |
| OR3A4P | NR_024128 | AS-NR-004-1-152 |
| ORAOV1 | AK294004 | AS-NR-004-1-153 |
| PACERR | NR_125801 | AS-NR-004-1-154 |
| PANCR | ENST00000503456 | AS-NR-004-1-155 |
| PANDAR | NR_109836 | AS-NR-004-1-156 |
| PARROT | ENST00000417112 | AS-NR-004-1-157 |
| PARTICL | NR_038942 | AS-NR-004-1-158 |
| PCAT1 | NR_045262 | AS-NR-004-1-159 |
| PCAT18 | NR_024259 | AS-NR-004-1-160 |
| PCBP2-OT1 | NR_109828 | AS-NR-004-1-161 |
| PCGEM1 | NR_002769 | AS-NR-004-1-162 |
| PDZRN3-AS1 | NR_046681 | AS-NR-004-1-163 |
| PICSAR | NR_024089 | AS-NR-004-1-164 |
| PINC | uc021vwo | AS-NR-004-1-165 |
| PISRT1 | NR_027070 | AS-NR-004-1-166 |
| PNKY | AI826101 | AS-NR-004-1-167 |
| POU6F2-AS2 | XR_242164 | AS-NR-004-1-168 |
| PRINS | AK022045 | AS-NR-004-1-169 |
| PRNCR1 | NR_109833 | AS-NR-004-1-170 |
| PSF inhibiting RNA | PSF_inhibiting_RNA_dna | AS-NR-004-1-171 |
| PTCSC3 | NR_049735 | AS-NR-004-1-172 |
| PTENP1 | NR_023917 | AS-NR-004-1-173 |
| PUNISHER | NR_027032 | AS-NR-004-1-174 |
| PVT1 | NR_003367 | AS-NR-004-1-175 |
| RGMB-AS1 | NR_033932 | AS-NR-004-1-176 |
| RHOXF1P1 | NR_131250 | AS-NR-004-1-177 |
| RMRP | NR_003051 | AS-NR-004-1-178 |
| RMST | NR_024037 | AS-NR-004-1-179 |
| RNY1 | NR_004391 | AS-NR-004-1-180 |
| RP11-354P17.15-001 | ENST00000569618 | AS-NR-004-1-181 |
| RP1-13D10.2 | ENST00000407522 | AS-NR-004-1-182 |
| RUNX1-IT1 | NR_026812 | AS-NR-004-1-183 |
| SALRNA1 | NR_126480 | AS-NR-004-1-184 |
| SAMMSON | NR_110000 | AS-NR-004-1-185 |
| SBF2-AS1 | NR_036485 | AS-NR-004-1-186 |
| SCAANT1 | BU569004 | AS-NR-004-1-187 |
| SENCR | NR_038908 | AS-NR-004-1-188 |
| Six3os | ENST00000437916 | AS-NR-004-1-189 |
| SMILR | ENST00000533992 | AS-NR-004-1-190 |
| SNAR-A1 | NR_004435 | AS-NR-004-1-191 |
| SNHG1 | NR_003098 | AS-NR-004-1-192 |
| SNHG11 | NR_003239 | AS-NR-004-1-193 |
| SNHG14 | ENST00000554726 | AS-NR-004-1-194 |
| SNHG15 | NR_003697 | AS-NR-004-1-195 |
| SNHG20 | NR_027058 | AS-NR-004-1-196 |
| SNHG5 | NR_003038 | AS-NR-004-1-197 |
| SNHG6 | NR_002599 | AS-NR-004-1-198 |
| ST7-AS1 | NR_002330 | AS-NR-004-1-199 |
| ST7-OT3 | NR_002332 | AS-NR-004-1-200 |
| ST7-OT4 | NR_002329 | AS-NR-004-1-201 |
| SUMO1P3 | NR_002190 | AS-NR-004-1-202 |
| TapSAKI | NR_126469 | AS-NR-004-1-203 |
| TARID | NR_109982 | AS-NR-004-1-204 |
| TCL6 | NR_028288 | AS-NR-004-1-205 |
| TDRG1 | NR_024015 | AS-NR-004-1-206 |
| TERMINATOR | uc010ppi | AS-NR-004-1-207 |
| THRIL | NR_110375 | AS-NR-004-1-208 |
| TIE1-AS | GU166386 | AS-NR-004-1-209 |
| TINCR | NR_027064 | AS-NR-004-1-210 |
| TUSC8 | NR_104174 | AS-NR-004-1-211 |
| U1 spliceosomal lncRNA | ENST00000415386 | AS-NR-004-1-212 |
| U79277 | U79277 | AS-NR-004-1-213 |
| uc.338 | ENST00000613162 | AS-NR-004-1-214 |
| uc.73A(P) | uc.73- | AS-NR-004-1-215 |
| UCA1 | NR_015379 | AS-NR-004-1-216 |
| UCH1LAS | NR_102709 | AS-NR-004-1-217 |
| UFC1 lincRNA | KJ809564 | AS-NR-004-1-218 |
| VIM2P | NG_022326 | AS-NR-004-1-219 |
| VLDLR-AS1 | NR_015375 | AS-NR-004-1-220 |
| WSPAR | NR_131252 | AS-NR-004-1-221 |
| X91348 | X91348 | AS-NR-004-1-222 |
| XACT | NR_131204 | AS-NR-004-1-223 |
| XIST | NR_001564 | AS-NR-004-1-224 |
| Yiya | NR_046189 | AS-NR-004-1-225 |
| ZEB2-AS1 | NR_040248 | AS-NR-004-1-226 |
| AIRN-1 | NR_047511 | AS-NR-004-1-227 |
| AIRN-2 | NR_047514 | AS-NR-004-1-228 |
| APOC1P1 | NR_028412; NR_028413; NR_028414 | AS-NR-004-1-229 |
| ARA | NR_136740; NR_136741; NR_136742; NR_136743; NR_136744; NR_136745; NR_136746 | AS-NR-004-1-230 |
| ATG9B-1 | NR_133652 | AS-NR-004-1-231 |
| ATG9B-2 | NR_073169 | AS-NR-004-1-232 |
| BDNF-AS-1 | NR_002832 | AS-NR-004-1-233 |
| BDNF-AS-2 | NR_002832; NR_033312; NR_033313; NR_033314; NR_033315 | AS-NR-004-1-234 |
| Beta-globin-transcript-1 | AY034469 | AS-NR-004-1-235 |
| BCAR4-1 | NR_024049 | AS-NR-004-1-236 |
| BCAR4-2 | NR_024049; NR_024050; NR_131216; NR_131217; NR_131222 | AS-NR-004-1-237 |
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